Приложение к Решению от 23.12.2011 г № 242 Описание
Флаг вагайского муниципального района и его описание рисунок не приводится.
Прямоугольное полотнище с отношением ширины к длине 2:3, состоящее из трех равных вертикальных полос - зеленой, синей и зеленой и несущее два стилизованных изображения кедров, выполненных желтым цветом и расположенных на границах полос; в нижней половине полотнища изображены белые полумесяц со звездой и равноконечный крест, перекрывающие изображения кедров в части стволов.
Обратная сторона аналогична лицевой.
Кедры служат указанием на лесные богатства территории, в особенности на кедрачи.
Полумесяц и крест символизируют собой историю заселения и освоения края сибирскими татарами и русскими переселенцами.
Ограниченное зелеными краями синее поле указывает на обилие водоемов и протекающую по территории района реку Иртыш.